Program Studi Sanitasi merupakan salah satu program studi pada Politeknik Kesehatan (Poltekkes)Kemenkes Kupang yang mempunyai tugas pokok dan fungsi menyelenggarakan pendidikan Kesehatan Lingkungan setingkat Diploma III dan bertanggung jawab terhadap Poltekkes Kemenkes Kupang. Program Studi Kesehatan Lingkungan berdiri sesuai Surat Keputusan Permenkes No.298/MENKES-KESOS/SK/IV/2001 tanggal 16 April 2001. Berdasarkan Surat Keputusan Pengurus Perkumpulan Lembaga Akreditas Mandiri Pendidikan Tinggi Kesehatan Indonesia (Perkumpulan Lam-PTKes) nomor 1116/LAM-PTKes/Akr/Dip/XII/2024 tentang status, nilai dan peringkat akreditasi maka status prodi DIIi Sanitasi Kupang terakreditasi Unggul
Program unggulan Jurusan DIII Sanitasi :
- Pengendalian dan Pemberantasan Vektor Penularan Penyakit
- Pengelolaan dan Pengawasan Kualitas Air Bersih
- Pengawasan Kualitas Air Limbah
- Pengawasan Pencemaran Lingkungan Fisik